Het is niet te voorspellen of jullie genetisch materiaal informatief zal zijn voor de merkers die we hebben.
Bovendien is de PGD-test (op het embryo) niet te vergelijken met de test om de mutatie (bij jullie of jullie familieleden) te vinden. Als een mutatie gekend is en beschreven in een laboprotocol, dan gaat een diagnose stellen op bloed of chorionvlokken vrij snel. We beschikken nl. over zeer veel DNA (uit de opgevraagde stalen). In het embryo daarentegen moeten we de aandoening kunnen detecteren in één of twee cellen. Dat is extreem weinig DNA: de PGD-test moet dus heel gevoelig zijn. Dat levert een aantal moeilijkheden op die tijd vragen.
Tot slot kan het ook gaan om een nieuwe ziekte, waarvoor nog nooit PGD werd gedaan. Dan moeten we vanaf nul starten.